Marlon Green blev født i El Dorado, Arkansas. Hans far, Mickinley Green, blev født i 1900 og giftede sig med Greens kommende mor, Lucy, den 10. april 1921. Greens bror Rudolph Valentino Green blev født i 1928, efterfulgt af Marlon (6. juni 1929); Jean Evelyn (1933); James Zell (1936); og Allen David (1941).
I 1936 eller 1937 flyttede familien til Lansing, Michigan, hvor han fandt arbejde hos Drop Forge Company. Senere blev han ansat i tandlæge J. Shelton Rushings husholdningsstab som det, som hans søn kaldte major domo.
Marlon Green blev medlem af United States Air Force, hvor hans sidste udstationering var at flyve SA-16 Albatross med 36th Air Rescue Squadron på Johnson Air Base i Tokyo, Japan. Under sin orlov i 1957 søgte han en stilling som pilot hos Continental Airlines og blev inviteret til en samtale, efter at han havde ladet spørgsmålet om racemæssig identitet stå ubesvaret i ansøgningen. Han undlod også at indsætte et billede af sig selv i den lille firkantede blok i øverste højre hjørne af ansøgningens første side, mens fem andre hvide ansøgere, der var mindre kvalificerede, blev ansat. Ifølge forskellige kilder blev han enten afvist på det tidspunkt, eller han blev ansat som det, der ville have været landets første afroamerikanske pilot i et større kommercielt flyselskab, men blev afvist efter at have meldt sig til orientering. Den 22. april 1963, efter mundtlige argumenter den 28. marts 1963, afsagde USA’s højesteret dom i sagen “Colorado Anti-Discrimination Commission v. Continental Airlines, Inc. 372 U.S. 714 nr. 146”, at Green var blevet ulovligt forskelsbehandlet. I 1964 ansatte American Airlines David Harris som den første afroamerikanske pilot i et større amerikansk passagerflyselskab. Efter sin sejr i Højesteret fløj Green for Continental fra 1965 til 1978, hvor han i første omgang fløj Vickers Viscounts fra Denver. Han blev kaptajn i 1966.
Green døde 80 år gammel i Denver, Colorado. Han var fraskilt og efterlader sig sine tre døtre og tre sønner. Den 16. februar 2010 opkaldte Continental Airlines i George Bush Intercontinental Airport i Houston, Texas, en Boeing 737-824 (N77518, cn 31605)> efter ham.
I sin levetid blev Green optaget i Arkansas Aviation Hall of Fame.