Mainstream succes
Marlon Wayans rykkede snart længere ind i rampelyset og vandt stor popularitet, da han og broren Shawn spillede sammen i WB-sitcomen The Wayans Bros., et stort set selvbiografisk show baseret på brødrenes virkelige forhold og personligheder. The Wayans Bros., der kørte fra 1995 til ’99, var med til at gøre Marlon Wayans til et af de mest fremtrædende medlemmer af sin dekorerede familie. I 2000 var han med til at skrive og spille med i sin mest populære film til dato, gyserfilmen Scary Movie, som blev en stor succes. Filmen, der kostede sølle 19 millioner dollars at lave, indtjente forbløffende 157 millioner dollars i biografen, hvilket gjorde den til den mest indbringende film nogensinde instrueret af en afroamerikaner (Keenen Ivory Wayans). Marlon Wayans var også med til at skrive og medvirke i flere af filmens efterfølgere: Scary Movie 2 (2001), Scary Movie 3 (2003) og Scary Movie 4 (2006). Ud over Scary Movie-serien har Marlon Wayans og hans bror Shawn medvirket i de populære spoof-film White Chicks (2004), Little Man (2006) og Dance Flick (2009).
Ud over de spoof-film, han laver sammen med sine søskende, har Marlon Wayans også kastet sig ud i mere seriøse film sammen med andre skuespillere. “Mange mennesker tror bare, at jeg er sjov og skør hele tiden,” siger han, “men jeg gik på et scenekunstgymnasium, så jeg er uddannet i dramatisk kunst. Jeg er bare tilfældigvis sjov.” Han fik stor ros for sin portrættering af en heroinmisbruger i den dystre film Requiem for a Dream fra 2000. I 2004 spillede han over for Tom Hanks i The Ladykillers.
Marlon Wayans blev gift med sin mangeårige kæreste Angelica Zackary i 2005. De har to børn, en søn Shawn (opkaldt efter Wayans’ bror) og en datter Amai.
Selv om han voksede op i en husstand, der allerede var fyldt med succesfulde entertainere, bukkede Wayans ikke under for presset fra at blive overskygget af sine søskende, men tog i stedet imod muligheden for at lære af sin familie. “Jeg er glad for at gøre det, jeg elsker, og gøre det sammen med dem, jeg elsker,” sagde han. På spørgsmålet om, hvorvidt det nogensinde bliver svært at blive instrueret af sine ældre brødre, svarede Wayans: “Mine brødre har fortalt mig, hvad jeg skal gøre hele mit liv, men i det mindste bliver jeg betalt for det nu!”